这个品类的数据长什么样
小分子化药的临床试验数据主要来源于临床试验机构、CRO公司及药企内部数据库。这些数据更新频率不一，部分公开数据库可能按季度或年度更新，而内部试验数据则随试验进展实时累积。文档结构通常包含结构化和非结构化数据。结构化数据如受试者基本信息、生化指标、不良事件代码（MedDRA）、药物剂量、试验方案关键参数等，常以CSV、Excel或数据库记录形式存在。非结构化数据则包括病例报告表（CRF）中的医生手写记录、影像报告、病理分析报告等，多为PDF或Word文档。字段与单位具有高度标准化要求，例如剂量单位（mg）、浓度（μg/mL）、时间点（天、周）、特定生物标志物值等。
这些特征在「工作流编排」这一环带来什么约束
小分子化药数据的多样性与标准化要求，对工作流编排提出了具体约束。数据源的离散性意味着需要多源数据集成模块，以从不同数据库、文件系统拉取数据。结构化数据的强规范性要求在数据预处理阶段进行严格的数据清洗、类型校验和单位转换，确保后续分析的准确性。非结构化数据的存在，特别是医生手写记录和病理报告，则需要引入OCR和自然语言处理（NLP）模块进行信息抽取与结构化，例如识别不良事件描述、疾病诊断等关键信息。此外，数据更新频率的不一致性要求工作流具备定时触发和增量更新能力，避免重复处理历史数据，同时确保预筛结果基于最新信息。对特定生物标志物或基因型数据的处理，可能需要外部工具API调用，以进行更深度的生物信息学分析。
配置怎么定
| 配置项 | 建议取法 | 这样取的依据 |
|---|---|---|
maxContext | 4000 字符 | 适应临床试验报告中常见段落长度，兼顾召回效率。 |
召回条数 | 前 10 条 | 在保证相关性的前提下，减少不必要的计算开销，聚焦核心信息。 |
相似度阈值 | 0.75 | 平衡召回的广度与精确度，避免过多噪声，确保匹配的可靠性。 |
PARSE_FILE_TIMEOUT_SECONDS | 600 秒 | 处理大型PDF或影像报告转录可能耗时较长，防止因超时中断。 |
http_request_timeout | 300 秒 | 外部生物信息学API调用响应时间不确定，提供足够等待时间。 |
分段长度 | 800–1200 字符 | 兼顾语义完整性与模型处理能力，避免长文本切分后信息丢失。 |
容易做错的三处
- 调用外部API时出现
HTTP 504 Gateway Timeout错误，原因在于外部API响应时间超过了工作流中设置的http_request_timeout限制。 - 知识库查询结果包含大量无关信息，导致预筛准确率下降，原因是
相似度阈值设置过低，未能有效过滤掉低相关度的文档片段。 - 工作流执行成功但某些关键字段（如不良事件类型、剂量单位）为空，原因在于非结构化数据处理模块（OCR或NLP）未正确配置，无法准确抽取或标准化这些信息。
怎么确认配好了
- 通过模拟提交包含结构化与非结构化数据的病例报告，检查工作流是否能正确抽取并结构化所有关键字段，并与预期结果进行比对，确认字段值与单位的准确性。
- 执行一系列具有明确预筛结果的测试用例，观察工作流输出的预筛结论是否与预期一致，并检查日志输出，确认所有分支逻辑均按设计执行。
- 验证数据更新机制，修改部分源数据后重新触发工作流，确认增量更新模块能识别并处理最新数据，同时旧数据未被重复处理。
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